A bordo del tren sucede un asesinato en uno de los vagones. Mientras Conan, Mouri y Amuro investigan la tensión aumenta, Masumi Sera también se encuentra a bordo y por lo visto Shuichi Akai, también. También Subaru Okiya y una misteriosa mujer se encuentran viajando dentro del tren. Haibara detecta la presencia de los Hombres de Negro en el tren y Vermouth confirma a Gin que Sherry se encuentra a bordo.